حسین شیرازی فرزند آیت الله شیرازی از مراجع تقلید شیعه امروز ۱۵ اسفندماه ۱۳۹۶ توسط نیروهای امنیتی در خیابان چهارمردان قم بازداشت و به مکان نامعلومی منتقل شد.
منابع نزدیک به آیت الله محمد شیرازی ضمن این تایید این خبر گفته‌اند “بازداشت حسین شیرازی، حدود ساعت ۱۰ صبح در خیابان چهارمردان قم، همراه با ضرب و شتم و استفاده از شوکر و تهدید اسلحه، از سوی نیروهای امنیتی صورت گرفته‌است و پس از بازداشت وی را به مکان نامعلومی منتقل کرده‌اند.”
آیت الله محمد شیرازی از منتقدان حکومت ایران به شمار می‌رود و فرزندش حسین شیرازی نیز روحانی است که اخیرا در جلسه‌ای تعریف جایگاه ولی فقیه در حکومت ایران را مشابه جایگاه “فراعنه مصر” توصیف کرده‌بود که خود را از هر گونه انتقاد و پاسخگویی فارغ می‌دانستند.
بعضی از رسانه‌های نزدیک به اصولگرایان، آیت الله شیرازی را مروج “شیعه انگلیسی” می‌دانند و به ایجاد تفرقه میان شیعه و سنی متهم می‌کنند. درمقابل، مقلدان این مرجع می‌گویند “او و خانواده‌اش به خاطر داشتن مواضع مستقل از حکومت ایران تحت فشار قرار گرفته‌اند.” آیت الله شیرازی یکی از مخالفان اصل ولایت فقیه است.